Dr. Ilja Hagen studierte Biologie in Regensburg und promovierte dort 2002 in Zellbiologie.

2003 trat er eine Stelle als Projektleiter im Bereich Array-Technologie am Kompetenzzentrum für Fluoreszente Biotechnologie (KFB) an und übernahm dort 2005 die geschäftsführende Funktion als Projektkoordinator.

2006 wechselte er zur Bayern Innovativ GmbH nach Nürnberg. Dort war er mehrere Jahre als Projekt- und Netzwerkmanager für das Forum MedTech Pharma tätig. Zu seinen Aufgaben gehörten u.a. die Entwicklung des Bayerischen Cluster Medizintechnik und die Mitwirkung am Nationalen Strategieprozess „Innovationen in der Medizintechnik“. Als Clustermanager unterstützte er vornehmlich KMU der Medizintechnik durch die Vermittlung von Kooperationspartnern und Spezialisten sowie bei fachlichen Fragen zu Produktzulassung und Erstattung.

Seit Oktober 2016 ist Ilja Hagen für die BioPark Regensburg GmbH als Projektmanager „Gesundheitswirtschaft“ tätig. Zusammen mit zahlreichen lokalen Akteuren hat er hier einen Masterplan Gesundheitswirtschaft für die Region Regensburg erstellt.